按照党的十五大关于推进机构改革的总体部署，全国各级人大、政协机关，法院、检察院机关，群众团体机关从2000年开始，分别进行了机构改革。

　　2000年12月26日，中共中央发布《关于全国人大、全国政协机关机构改革的意见》。按照中央精神，全国人大机关各工作委员会和专门委员会办事机构职责作适当调整，重点理顺办公厅研究室与部门专门委员会办事机构、财政经济委员会内设机构与预算工委内设机构的职责关系，将资料管理、后勤服务和办刊等工作划转事业单位承担。全国政协机关调整和加强了人民政协理论政策综合研究、对内对外宣传和全国政协委员联络等工作职责。这次改革，全国人大、全国政协机关从实际需要出发，对人员编制作了适当精简，以改革为契机，把精简人员编制与深化干部人事制度改革结合起来，充实了专门人才，加强业务工作力量，优化了干部队伍结构。

　　根据中央的改革精神，最高法院、最高检察院机关加强并完善了法律赋予的审判检察职能，调整规范了党务、政工机构。最高法院新设了立案庭和审判监督庭，实现了立审、审执、审监三个分离。最高人民检察院新设、分设了职务犯罪预防厅、控告检察厅和刑事申诉检察厅，强化了内部监督制约机制，加强了预防职务犯罪和反腐败力度。改革后，普遍提高了业务人员比例，优化了干部队伍。

　　由中央机构编制管理部门直接管理机构编制的全国总工会、共青团中央、全国妇联、中国文联、中国作协等21个群众团体机关，按照2000年12月31日中共中央办公厅、国务院办公厅下发的改革意见进行了改革。群众团体机关的人员编制按25％左右的比例精简，整个改革于2001年上半年完成。改革后，除全国工商联外的20个群众团体机关人员编制由3442名精简为2644名，总体精简23.2％。

　　按照中央部署，地方各级人大、政协、法院、检察院也相继进行了机构改革。